La Chiesa di San Lazzaro viene costruita come parte del complesso ospedaliero dei Mendicanti. Dal tipo di arredi, opere, suppellettili, paramenti ed oggetti sacri ivi contenuti si comprende bene che si tratta di una Chiesa che, pur non essendo un luogo parrocchiale, è organizzata per somministrare tutti i sacramenti, rispettare i tempi liturgici, effettuare tutti i riti del calendario liturgico, custodire centinaia di reliquie provenienti da tutto il Mediterraneo, ospitare delle confraternite di devozione.

Questa chiesa è pertanto architettonicamente parte coesa dell’Ospedale, sin dall’inizio ideata come luogo di “cura dell’anima” che non si contrappone alla “cura del corpo”, ma diventa un tutt’uno come insegna la sapienza orientale, in una visione di integrità della salute umana.